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Le furtif variant Lambda de la covid s'attaque aux anticorps naturels ou produits par la vaccination - Demain l'Homme

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Cette actualité a été publiée le 21/07/2021 à 19h05 par Cedre.

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Le furtif variant Lambda de la covid s'attaque aux anticorps naturels ou produits par la vaccination


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Covid : le variant Lambda, qui inquiète l'Amérique du Sud, arrive en Europe

 

L'apparition de nouvelles souches du Covid-19 se poursuit. Tandis que le variant Delta est au centre de l'attention en Europe, un autre variant, dénommé Lambda, dont le nom scientifique est C.37, inquiète particulièrement l'Amérique du Sud.

 

Voici ce que
nous savons

 

Ses mutations l'aident à esquiver le système immunitaire. Les chercheurs se démènent pour déterminer s'il est plus dangereux ou transmissible que Delta

 

 

Une variante du coronavirus connue sous le nom de Lambda, qui a largement glissé sous le radar au cours des neuf derniers mois, est désormais à l'origine de presque toutes les nouvelles infections au Pérou.

Lambda (également connue sous le nom de C.37) a été détectée pour la première fois au Pérou en août 2020 et s'est propagée dans 29 pays, dont beaucoup en Amérique latine. Et, depuis le 20 janvier 2021,668 infections Lambda ont été signalées aux États-Unis. Au Pérou, Lambda est désormais responsable de plus de 90 % des nouveaux cas de COVID-19, une forte augmentation par rapport à moins de 0,5 % en décembre. Le pays a déjà subi la pire mortalité au monde due au COVID-19 ; la maladie a tué environ 0,54 pour cent de la population.

La variante Lambda a probablement causé le nombre élevé d'infections au cours de la deuxième vague entre fin mars et avril, a déclaré le ministre péruvien de la Santé Óscar Ugarte lors d'une conférence de presse. Au Chili voisin, où le vaccin principal est le CoronaVac chinois, Lambda représente 31% des cas séquencés au cours des 60 derniers jours.

Le nombre élevé de cas se produit même si 58,6 pour cent de la population chilienne sont entièrement vaccinés et 10 pour cent supplémentaires ont reçu une dose unique. La faible efficacité du vaccin peut-être en partie à blâmer. Une étude de l'Université du Chili a révélé qu'une seule dose du vaccin CoronaVac n'était efficace que de 3%, mais que ce chiffre est passé à 56,5% après les deux doses.

 

 

« Pourquoi le Chili obtient des taux d'infection si élevés est déroutant, et cela est probablement dû à plusieurs facteurs. En raison de leur couverture vaccinale élevée, les restrictions ont été assouplies un peu trop tôt, ce qui aurait pu entraîner une augmentation des cas », explique Pablo Tsukayama, microbiologiste à l'Universidad Peruana Cayetano Heredia à Lima, au Pérou. C'est Tsukayama qui a repéré pour la première fois la variante Lambda après avoir séquencé systématiquement les échantillons déposés entre janvier et mars 2021.

"Mais il est également possible que les principales variantes en circulation, Gamma et Lambda, aient des propriétés d'échappement immunitaire qui conduisent à une protection réduite contre les vaccins."

La possibilité que Lambda puisse esquiver le système immunitaire a conduit l'Organisation mondiale de la santé à le désigner comme variante d'intérêt (VOI) le 14 juin. L'OMS catégorise un virus comme VOI lorsque les modifications génétiques du virus sont si importantes qu'elles peut affecter sa transmissibilité, la gravité de la maladie, l'échappement immunitaire, le diagnostic ou la thérapie ; et il se propage rapidement à travers une communauté.

Alors que l'Amérique latine ne compte que huit pour cent de la population mondiale, elle représente plus de 20 pour cent des cas mondiaux de coronavirus et 32 pour cent des décès dus au COVID-19 dans le monde. Bien que la région signale toujours plus de la moitié des décès enregistrés dans le monde, seul un Latino-Américain sur 10 a été complètement vacciné. Dans des pays comme le Honduras et le Guatemala, le nombre est inférieur à 1 pour cent.

"Je pense que nous sommes sur le point de voir une autre situation critique dans les prochaines semaines en Amérique latine", a déclaré Alfonso Rodriguez-Morales, épidémiologiste et vice-président de l'Association colombienne des maladies infectieuses. En effet, dans certains pays, les programmes de vaccination n'ont toujours pas complètement vacciné plus de 5 à 10 pour cent de leur population « et c'est très critique ».

 

 

Pourquoi est-il
difficile de détecter
les variantes ?

 

 

La variante Lambda est restée non détectée pendant de nombreux mois car elle était souvent confondue avec Gamma, la variante identifiée pour la première fois au Brésil et également connue sous le nom de P.1.

En raison de ressources limitées, l'Institut national péruvien de la santé utilise une méthode rapide et abordable basée sur les modifications du gène ORF1ab du virus. Cette méthode ne peut pas distinguer les variantes Beta et Gamma de Lambda. Pour trier la variante Lambda des autres, il faut un séquençage génétique, un processus long et coûteux.

« Nous avons une capacité très limitée dans la région pour mener une surveillance génomique, il est donc difficile d'estimer la prévalence complète de Lambda. Pourquoi une variante devient dominante n'est pas facile à prédire. Il est donc important que nous augmentions la capacité de séquençage partout, pas seulement aux États-Unis et en Europe », déclare Tsukayama.

 

 

Qu'est-ce qui
a changé dans
la Lambda ?

 

La variante Lambda est très inhabituelle en raison de la façon dont sa protéine de pointe est modifiée par rapport aux autres variantes. Il présente des mutations à 14 positions, dont une longue étendue de sept acides aminés qui a été supprimée d'une région de la protéine de pointe appelée domaine N-terminal ou NTD. Au-delà de ceux-ci, Lambda présente également des mutations du gène ORF1ab que l'on trouve dans d'autres variantes préoccupantes : Alpha, Beta et Gamma.

Le gène ORF1ab code pour une grande protéine, dont certaines parties aident le coronavirus à se répliquer et à supprimer la réponse immunitaire humaine. En raison de son importance, les scientifiques développent déjà des thérapies antivirales pour cibler les protéines ORF1ab.

Les sept acides aminés supprimés de la NTD appartiennent à un supersite NTD où la pointe est attaquée par de nombreux anticorps puissants du corps. De nombreuses variantes, dont Alpha, Beta et Gamma, hébergent également des mutations dans cette zone, suggérant que cette région est importante pour l'évolution du virus.

 

 

« NTD n'est pas crucial pour l'exécution des fonctions importantes du virus et, par conséquent, il est facile pour le virus de muter tout en restant viable, de manière à échapper à la réponse anticorps existante », explique Shee-Mei Lok, spécialiste des maladies infectieuses à Université nationale de Singapour.

Les anticorps anti-NTD fabriqués naturellement dans le corps peuvent empêcher les virus ultérieurs d'entrer dans la cellule même après s'être attachés au récepteur ACE2 à la surface de la cellule, c'est pourquoi les développeurs de vaccins se concentrent sur cela.

Parmi les autres mutations de Lambda, il y en a une unique à l'emplacement 452 qui est également mutée dans d'autres variantes hautement transmissives : Delta, Delta Plus, Epsilon et Kappa. Alors que la mutation L452Q de Lambda n'a jamais été vue auparavant dans une variante, les scientifiques prédisent que les mutations à la position 452 augmentent la capacité du SRAS-CoV-2 à infecter une cellule.

La position 452 se produit dans la partie de la protéine de pointe qui interagit directement avec la protéine réceptrice ACE2 trouvée sur le poumon et d'autres cellules humaines, et cette interaction lui permet d'entrer dans le corps.

« La position 452 est reconnue par de nombreux anticorps neutralisants. Des mutations sur ce site pourraient entraîner une diminution de la liaison et donc une protection moindre de certains vaccins chez certaines personnes, celles avec des réponses marginales pour commencer », explique Michael Diamond, immunologiste à la Washington University School of Medicine.

Evgeni Sokurenko, microbiologiste à l'Université de Washington, a montré qu'une seule mutation à ce poste aurait pu déclencher la récente expansion rapide des variantes de COVID-19 . Une mutation similaire - L452R - dans la variante Epsilon provoque une infectiosité élevée, améliore la capacité du virus à se développer et réduit l'activité neutralisante de nombreux anticorps .

 

 

 

Qu'est-ce que
la variante
Lambda Covid ?

 

Une NOUVELLE variante de coronavirus qui, selon les experts, est "plus mortelle" que la souche Delta a déjà ravagé 30 pays.

La variante Lambda a été découverte pour la première fois au Pérou et elle est aujourd'hui déjà présente dans une trentaine de pays.

La variante est actuellement classée comme « en cours d'investigation » et les experts pourraient alors la classer comme « préoccupante » une fois qu'ils ont effectué une évaluation des risques.

Cela dépendra de la transmissibilité de la variante et du nombre de cas détectés.

L'autorité sanitaire malaisienne affirme que la variante provient du Pérou, un pays avec l'un des taux de mortalité Covid les plus élevés au monde.

Également connue sous le nom de C.37, la souche Lambda a été détectée pour la première fois au Pérou en 2020 avant de se propager rapidement dans 30 pays, dont la Grande-Bretagne.

La protéine de pointe L452Q est particulièrement préoccupante pour les virologues en raison de son potentiel à infecter des cellules humaines comme la mutation L452R dans la variante Delta hautement infectieuse.

Les scientifiques péruviens ont remarqué la variante en décembre 2020 alors qu'elle ne représentait « qu'un échantillon sur 200 ».

En mars 2021, ce chiffre est passé à 50% des cas.

Aujourd'hui, ce chiffre s'élève à 82%, selon l'Organisation mondiale de la santé (OMS).

Le Pérou a l'un des taux de décès de Covid les plus élevés au monde

 

 

La Lambda
est-elle
plus contagieuse ?

 

 

La variante Delta est la raison pour laquelle la levée des restrictions a été repoussée au Royaume-Uni et les experts ont averti que la variante Lambda pourrait être encore plus contagieuse que cela.

Pablo Tsukayama, scientifique moléculaire à l'université Cayetano Heredia à Lima, a déclaré que l'augmentation rapide du virus "suggérerait que son taux de transmission est plus élevé que les autres variantes".

Au Chili voisin, elle représente près d'un tiers des cas, bien que les scientifiques soient incapables de dire quelle souche est la plus transmissible.

Huit cas ont déjà été signalés au Royaume-Uni, tous liés à des voyages à l'étranger.

L'Organisation mondiale de la santé a classé Lambda comme variante mondiale d'intérêt le 14 juin.

L'OMS a dit qu'il a des mutations qui augmentent la transmissibilité.

Le virologue de l'OMS Jairo Mendez-Rico a déclaré au média allemand DW : "Jusqu'à présent, nous n'avons vu aucune indication que la variante lambda est plus agressive."

"Il est possible qu'il ait un taux de contagion plus élevé, mais plus de travail doit être fait dessus."

Il a ajouté : "Il est probable que le SARS-CoV-2 deviendra plus transmissible au cours de son évolution mais pas nécessairement plus dommageable pour l'hôte."

 

 

Les vaccins
fonctionneront-ils ?

 

(...)

Il a été récemment découvert au Royaume-Uni que les vaccins étaient moins efficaces contre la variante Delta.

On ne sait pas encore avec certitude à quel point les jabs seront efficaces contre la variante Lambda.

Des chercheurs chiliens ont découvert que la variante pourrait être résistante aux vaccins Covid.

 

 

 

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LE CORONAVIRUS

 

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(...)

Des scientifiques anglais ont écrit dans un article qui n'a pas encore été évalué par des pairs : "Nos données montrent pour la première fois que les mutations présentes dans la protéine de pointe de la variante Lambda confèrent une échappatoire aux anticorps neutralisants et à une infectivité accrue."

"Il est possible qu'il présente des taux d'infection plus élevés, mais nous n'avons pas encore suffisamment de données fiables pour le comparer au gamma ou au delta."

 

Source anglaise

 

 

Covid : le variant Lambda, qui inquiète l'Amérique du Sud, arrive en Europe

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Auteur : Demain l'Homme - sosplanete.info - #3PFMD, Plateforme Participative Pacifique pour un Futur Meilleur Durable - Association Terre "sacrée" (parce qu'on la ma$$acr€ !)

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